水井的赔偿标准主要依据以下几个方面:开凿工程、用料及用工等费用:水井补偿包括开凿工程所需的费用、使用的材料以及所需的人工费用。废、枯井的补偿:废井和枯井按照同类井补偿标准的30%到50%进行补偿。机井的补偿:机井的补偿根据井深进行分段计算,具体标准如下:土井:直径1.2米,补偿90元/米。砖井(包括